[CJ F.A.N.]

Возможна проблема возникла из-за что я использую и dpkg, и apt-get, и synaptic »

Я тоже использую иногда и то, и то))) Например, если надо установить программы или пакеты из комплекта дисков с Debian, то использую Synaptic. А если качаю какие то Debian пакеты, то использую dpkg. Так же если ИКСЫ выгружены, то часто пользуюсь aptitude или apt-get, но никогда не повреждались индексы программ. Возможно что в корневом разделе ошибки

Кстати, возможно что когда-то были установлены какие либо пакеты с ошибками, возможно из-за них так же все эти проблемы