R.i.m.s.k.y.,
А не пробовал без "Wow6432Node" в строке реестра? Не знаю, у кого как, а у меня винда сама закидывает в реестре куда надо.
к примеру
Код:

Root: HKLM; SubKey: SOFTWARE\GNU\ffdshow; ValueType: string; ValueName: pth; ValueData: {app}\FFDShow; Flags: uninsdeletevalue deletevalue; Check: not IsWin64; Components: ffd
Root: HKLM; SubKey: SOFTWARE\GNU\ffdshow64; ValueType: string; ValueName: pth; ValueData: {app}\FFDShow64; Flags: uninsdeletevalue deletevalue; Check: IsWin64; Components: ffd