[cameron]

Скорее всего буду переделывать рейд, можете посоветовать как правильно организовать настройку с теми же аппаратными мощностями. »

разнести КД и SQL на разные хосты. для КД мощь не нужна.

Если использовать два винта на 1 рейде под систему и один под пользовательские данные и на нем будет включен кеш для SQL.»

что такое "кеш для SQL?"
по-хорошему нужно разности всё это на разные массивы.

Такая система будет работоспособней??????? »

я думаю что вы не получите ощутимого профита.
R5 на 3 дисках конечно чутка быстрее на чтение чем одиночный диск, но явно имеет пенальти на запись, даже, думаю, по сравнению с одним винтом.
в общем нужно большее кол-во винтов, я бы сказала так.

да, не забывайте что у вас raid контроллер который серьёзно использует CPU для ребилда и проверок чётности.