[DmB89]

aoi-jap, насколько я понял, форматирование требуется для раздела, на который будет устанавливаться операционная система, причём Windows? В таком случае, Partition Magic'ом следует пользоваться только для разбиения диска на несколько разделов, с быстрым форматированием. И категорически рекомендую пользоваться форматированием (неважно - быстрым или обычным) при помощи установщика Windows!
Неоднократно проскакивали жалобы, в том числе и на форуме (сейчас не найду), что частенько встречаются глюки при форматировании сторонними утилитами (чаще назывался именно Partition Magic), и после этого установки Windows. Я и сам один раз столкнулся с чем-то подобным. По моему личному мнению, происходит это потому, что помимо собственно обнуления таблицы размещения файлов при форматировании посредством Windows происходит назначение прав доступа к разделу, причём именно так, как это необходимо для правильного функционирования системы. После форматирования сторонними утилитами раздел скорее всего будет иметь только лишь права доступа "Разрешено" для группы "Все", что мягко говоря, не совсем верно... Разумеется это относится только к файловой системе NTFS, но она и является наиболее распространённой в данный момент.

P.S. А если уж так силён страх перед "загрузочными" вирусами, то перед установкой системы можно выполнить fixmbr из консоли восстановления.