minos66, вот ссылка по указанной вами проблеме для Win2003 -
The Chkdsk.exe utility incorrectly identifies and resets security descriptors in Windows Server 2003
Но меня что смущает - там говорится о нарушении списков доступа (ACL) после работы chkdsk.exe. А у меня проблема в том, что пропадает свободное пространство. Плюс оно пропадает не только после работы chkdsk.exe, но и после полного форматирования (или в нем тоже задействована chkdsk.exe?)
Также в статье указано, что данная проблема была исправлена в SP2, а у меня установлена Win2003Ent R2 SP2 (извиняюсь, что не указал это сразу), да и версия файла Ntfs.sys у меня выше - 5.2.3790.3959.
