[Amigos]

система очень долго стала грузится (во время бутскрина). Если раньше мой "огрызок.iso" на этом этапе загружался в половину load-бара, сейчас же "полосочка" проходит раз 15 тот самый load-бар и только потом дальше.. Как укоротить время? »

забить, это время не начто не влияет.

Так вот после установки системы, в папке "Мой Компьютер" появились следующие ярлыки: см. прикрепленный скиншот. »

да, это Nlite добавил, повторите операцию "интегрировал последний UpdatePack, потом ExtremePack для него, после покопался в дистрибутиве с помощью nLite" ещё раз, уделив больше внимания галочкам в нлайте.
можете ознакомится с этой темой Безопасный конфиг для NLITE