[amel27]

если запуск SFX идет на рабочей системе то нужно запустить SFX, если через RunOnceEx»

ИМХО проще распознать запуск из RunOnceEx, чем зафиксировать "полную загрузку" (кстати, весьма расплывчатое понятие)... например, по наличию BSPI-ключа в ветке RunOnceEx (ключ удаляется только после отработки всех параметров-команд):

Код:

@Echo Off

REG QUERY HKLM\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\RunOnceEx\BSPI 2>Nul

If ErrorLevel 1 (
  Echo Script run from Console
) Else (
  Echo Script run from RunOnceEx
)

PAUSE >Nul