[Guest]

Давайте разберемся как у вас зеркало было настроено.
Было 2 винта. Одинаковые или нет? Зеркалился винт на винт или том на том? Если том на том, тогда напишите как было все разбито и что на что зеркалилось.
Если винт на винт, то винты должны (всмысле данные на них) быть идентичны и то что работало на первом, должно работать на втором. Если у Вас и на первом hdd системный том был вторым, то должно работать.

Добавлено:

Да еще хочу сразу определится.
Системный раздел (активный) это тот для которого установлено поле BootIndicator в таблице разделов. Это раздел в котором нахордится загрузчик.
Загрузочный раздел - это раздел, который содержит системные папки Windows (%SystemRoot%), и этот раздел может совпадать, а может и не совпадать с системным.