AjaX_too, можно использовать страницу с дополнительными задачами, т.е. секция [Tasks]
Код:
[Tasks]
Name: chk1; Description: Ключ 1; GroupDescription: Дополнительно:
Name: chk2; Description: Ключ 2; GroupDescription: Дополнительно:
[Registry]
Root: HKCU; Subkey: Software\My Company1; Tasks: chk1; Flags: uninsdeletekeyifempty
Root: HKCU; Subkey: Software\My Company2; Tasks: chk2; Flags: uninsdeletekeyifempty
