[Raf-9600]

Порт, на котором висит сидюк - это тот, который находится не внизу, а где-то посередине платы, я правильно понимаю? »

Угу

И будучи повешенными на кабель, вставленный в этот порт, оба винта видны в системе? »

Тестировал только на одном винчестере. Просто оба подключить на этот шнур, физически невозможно.

А в нижнем порту, который на контроллере ITE, диски в BIOS видны, в операционке - не видны вообще? »

Угу

в Диспетчере устройств диски как устройства есть? »

Неа

А оптический привод, подключенный к этому же нижнему порту, в Windows видно? »

Не тестил.