[amel27]

Как сделать так, чтобы клавиатура и мышь оставались заблокированными после закрытия программы, и разблокировались при запуске другой? »

надо же было так сформулировать - ничего не понял... proxy, ты телепат!

- кто инициирует блокировку?... та "программа", что потом закрывается?
- как запускается "другая программа", если консоль еще заблокирована?.. планировщиком?
- что такое "программа" - "эта" и "другая"?... AutoIT-скрипт или сторонняя (управляемая) программа?

З.Ы. можно симулировать закрытие, а на самом деле скрыть все окна и следить за процессами - блокировать/разблокировать