[Fighter]

W2k3
Пуск=>Справка и поддержка  Найти=>adprep
там все написано

adprep.exe  предлагает ее запустить на контроллере, т.е. на 2000

да, "оно" Вам предлагает подготовить Ваш домен (лес) 2000
для перехода на 2003

Ты имеешь ввиду создаем новый домен на 2003?

я бы извернулся проще...
устанавливаем W2k3 "вгоняем" его в состав домена под W2K
ну а дальше проделываем все вышепривед. т.е. подготавливаем
АД на 2000 пожнимаем ее "дубль" на 2003, передаем все роли,
реплицируем, "опускаем" 2000 до резервного контроллера домена
(если все ок по желанию "убиваем" АД 2000)  
успехов