[dj_gvozd]

может вызывать такую ошибку? »

Я лично считаю, что не может. Вероятность того, что Ваш бэд-блок попал на этот файл и повредил его, ничтожна. Кроме того, файл pci.sys является системным (это драйвер, по описанию самой Microsoft - перечислитель устройств Plug and Play), без него система должным образом функционировать не будет. Контрольная сумма MD5 для версии 5.1.2600.2180 - 41EE4966E85777D83E4384F5EA3C8590 (посчитать и сравнить можно этой программой)

Это выражается в темном экране, в углу экрана тестовый квадрат »

Лишний раз намекает на, вероятно, кривой BIOS видеокарты или проблему GPU, если она даже BSOD показать не в состоянии - дампы есть, а изображения нет.
Гугление показало, что наиболее частые глюки, связанные с этим файлом - BSOD 0x7E и исчезание этого файла - не Ваш случай. В качестве одного из потенциальных решений проблемы, можно также предложить перепрошить BIOS, чтобы устранить вероятную кривизну (а, точнее, проблемы взаимодействия с видеокартой) материнки (современный Asus, о качестве и бажности которых я могу часами слагать нецензурные оды).

Лазил только что на сайт Asus - более новых BIOS нет.