[elChoopacabra]

galakt
То, что при тихой установке k-lite кодеки ставятся/регистрируются иначе звучит как минимум маловероятно. НО у меня есть большие сомнения, что при "тихой" установке срабатывает раздел Miscellaneous (Detect Broken Codecs/Detect Broken DirectShow filters) и возможно проблема кроется тут. Как вариант k-lite ставить "тихо", а упомянутое запускать ручками (или используя AutoIt), вытащив из распакованного пака. Но это всё теория, сам не заморачивался, ввиду отсутствия проблем с "тихой" инсталляцией.
Добавлено:
Как оказалось, даже распаковывать ничего не надо. Упомянутый Codec Tweak Tool можно скачать тут и если есть желание позамарачиваться, попробуйте запустить его после "тихой" установки.