[Petya V4sechkin]

kt626, по вашему алгоритму:

Код:

@Echo Off
SetLocal EnableExtensions EnableDelayedExpansion

Set Templates=Template1 Template2 Template3
Set FileMask=*.abc
Set Folder=C:\MyFolder

For /F "Delims=" %%I In ('Dir /A-D /B "%Folder%\%FileMask%" 2^>nul') Do (
  Set FN=%%~nxI
  For %%K In (%Templates%) Do (
    If "!FN!" Neq "!FN:%%K=!" (
      MD "C:\%%K" 2>nul
      Move "%%I" "C:\%%K"
    )
  )
)

Если нужно учитывать вложенные папки, добавить опцию /S в команду Dir (но тогда придется разбираться с возможными коллизиями в случае одинаковых имен файлов).

Ограничение: в именах не должно быть символа ! (восклицательного знака).