[nokiax86]

Это как, по частям? А целиком клонировать пробовали? »

Я целиком и делал, второй раздел вообще пустой, я к тому, что на диске нет двух и более активных разделов, а есть лишь один активный, с операционнкой.

Грузился через бут меню, загрузочные файлы на месте, их просто невозможно не записать, ведь ОС устанавливалась "клонированием".
С бут ини всё хорошо, ведь со старого всё отлично грузилось.
Кстати жёсткие диски одного и того производителя, сеагейт, оба сата и абсолютно идентичны, отличаются только обьёмом.