[DimTiger]

CyberDaemon

Отключи в БИОСЕ второй винт. Винда при загрузке должна будет сама его найти и поставить в конец спика имен, перед CD

А где в БИОСе копать?

и еще

Есть. Буквы у дисков, кроме С изменятся. Некоторые проги, которые жили на других дисках, могут перестать работать.

в PMagic есть такая прога, Drive Mapper кажется называется. Она обычно после каждого изменения в структуре (создания или слияния партишнов) автоматически ищет и исправляет ссылки в прогах и адресах.

Может ли она помочь после действий по вашему варианту?