[Bobbydream]

Могу сказать, что в 90% случаев после чистки реестра появляются глюки:
не удаляются папки и файлы (из-за сбоя в правах доступа), слетает планировщик заданий и т.п.
Остаётся только ждать, пока производители подобного софта учтут особенности реестра этой оси.
Всё же они отличается от Windows Vista %)
А для более опытных - можно и ручками реестр подчистить по мере необходимости.

З.Ы. практически никаких побочных эффектов я не заметил при использовании CCleaner.
Но не подумайте, что я призываю вас использовать данный софт.
В любом случае возможны послеглюки, так что не забывайте делать полный бэкап системы
перед использованием любого софта такой направленности.