Master Boot Record (MBR) - упрощенно, это маленькая программка, записанная в первом секторе диска, с выполнения которой начинается загрузка операционной системы. После включения компьютера сначала выполняется программа, прошитая в ПЗУ BIOS (тесты, начальная инициализация устройств...), и в конце своей работы она находит этот сектор на загрузочном диске, считывает данные из него в память компьютера и передает им управление.
Как выглядит MBR, можно посмотреть любым редактором дисков. Но не стоит ничего в ней править.
Очень неплохая статья о структуре MBR
здесь