[gora]

Значит ли это, что 12ый вариант установки можно запускать из RunOnceEx? »

Да.
Варианты 1,2,4,5 так и делают, но без применения сторонних программ.

smitov, видимо у Вас тот случай, когда нужно самому садится за ваш компьютер и все подробно изучать. Пишите в ПМ, дабы не засорять ветку, и очень подробно: сколько дисков в системе и свободное место на них, размер ОЗУ, на каком диске стоит система, месторасположение инсталлятора при запуске, полный путь к переменной %TEMP%, наличие антивирусов в системе и их активность во время установки, как устанавливалась сама система и обновления к ней, использовался ли UpdatePack, какие аддоны использовались, почему не использовали установку .NET в качестве аддона, пошагово ход установки .NET и т.д.