[Delirium]

акой размер файлов *.mdf и *.ldf для баз tempdb и model лучше выставить (интересует initial size) »

А зачем вообще трогать эти базы? Вы их используете напрямую?

Так же интересует параметр Autogrowth, прочитал много статей все советуют по разному, кто-то говорит ставить в %, а кто-то определенное количество МБ »

Я всегда ставлю в % - и не парюсь с постоянными проверками размера файла. Надо - увеличит.

Следует ли выполнять shrinkdatabase(TEMPDB) »

Если есть желание, можно запихать в планировщик выполнение команды и забыть про нее.