FunkyByte, придется обработку делать в самом скрипте:
Код:

@Echo Off
SetLocal EnableExtensions EnableDelayedExpansion
:CmdLine
Set P=%1
If "!P!"=="" GoTo :Cont
If /I "!P:~0,12!"=="/FirstParam:" Set FirstParam=!P:~12!
If /I "!P:~0,10!"=="/SecParam:" Set SecParam=!P:~10!
Shift
GoTo :CmdLine
:Cont
Echo FirstParam=!FirstParam!
Echo SecParam=!SecParam!
Здесь 12 - длина строки "/FirstParam:", 10 - длина строки "/SecParam:"
Результаты в переменных !FirstParam! и !SecParam!