А может отказаться от AVI. И воспользоваться MKV форматом.
перегоняем оба файла в mkv формат, и вводим в командной строке следующее "Copy /b File1/mkv + File2.mkv Final.mkv"
и всё.
разные разрешения в данном случае даже малюхонькой проблемой сложно назвать. Плеер сам подстроится и даже искажений размеров не будет.
Вот когда абсолютно разными Видео или звуковыми кодеками пожато то возможно появится какой нить глюк.
только что попробовал так склеить два файла c абсолютно разными кодеками, разрешениями, да и вобще между ними ничего общего
x264+AAC
Xvid+PCM
мнгновенный переход, кто не знает и не догадается.
