[Vadikan]

1. Что такое "жёсткие ссылки", как они создаются и чем отличаются от тех, которые образуются по "создать ярлык"? »

Как работают жесткие и символические ссылки

2. Есть ли какие-то специфические требования к такого рода запускам по ярлыкам? »

Жесткая ссылка - это не ярлык. Символическая больше на него похожа.

3. Насколько программы "привязаны" к своей, кровной ОС? »

Это зависит от программы. Многие будут работать.

Учтите, что для запуска файлов из другой ОС вашей учетной записи требуется получить доступ к файлам другой ОС, и он перманентный.

[OrdosDeviator]

Не хотите гребтися с командной строкой, Far и Alt+F6.
Единственно, такого можна понасоздавать, что експлорер и удалить не сможет. Тогда Far же Shift+Del - удалить мимо корзины.