[okshef]

На время установки измените активность раздела.

[Sozdatel1989]

okshef, каким образом?

[okshef]

Способов много, например, с помощью DISKPART (Параметры командной строки DiskPart):
Выберите нужный вам раздел с помощью команд

Код:

list disk
sel disk X
list part
sel part Y
active

X и Y - номера HDD и раздела, соответственно.
последняя команда делает раздел активным.

P.S. Вход в командную строку в Windows PE - Shift + F10

[Sozdatel1989]

okshef, это я знаю, как заставить винду, делать это(изменять активность раздела) автоматом? Ибо в ручную это не проблема.
Может можно написать bat файл с этими командами и принудить винду 1 раз его запустить после установки?

[okshef]

используйте сценарий Diskpart в процессе автоматической установки.