[exo]

Сделать домен один момент: не называйте свой домен domain.ru или domain.com.
Файловый сервер
настроить ДНС сразу скажу пару моментов:
устанавливаете его только с AD, прописываете там только перенаправление на провайдерские ДНС, и ничего не удаляете!
настройка DHCP

т.д чтоб определенные пользователи имели доступ к интернет! остальные просто в локальной сети. »

этим занимается прокси сервер. ищите про него в интернете.

А также 5 и 10 компьютеров в отдельную под сеть. »

раз у вас циски - VLAN вам в помощь.

[Alex_wtf]

а если варианты развития без VLAN я не еще не уерен в том , что мы нуждаемся в ней.

[exo]

а если варианты развития без VLAN »

как вариант - сеть за маршрутизатор ставьте.