[blackeangel]

greg zakharov, без паники
код мой такой

Код:

public static String[] parsinganytextfile(String line) {
        ArrayList<String> result = new ArrayList<String>();
        Pattern pattern = Pattern.compile("^(.*)(.*[r|-][w|-][x|-][r|-][w|-][x|-][r|-][w|-][x|-])(.*)$");
        Matcher matcher = pattern.matcher(line);
        if (matcher.find()) {
            for (int i = 1; i <= matcher.groupCount(); ++i) {
                result.add(matcher.group(i));
            }
        }
        return result.toArray(new String[0]);
    }

    public static void RecalcRules() {
        String InputTextFile;
        JFileChooser fileopen = new JFileChooser();
        int ret = fileopen.showDialog(null, "Открыть файл");
        if (ret == JFileChooser.APPROVE_OPTION) {
            File file = fileopen.getSelectedFile();
            InputTextFile = file.getAbsolutePath();
        } else {
            return;
        }
        String OutTextFile = InputTextFile + "_new";
        //погнали
        String[][] TextMass = new String[0][];
        try {
            TextMass = Files.lines(Paths.get(InputTextFile))
                    .map(g -> parsinganytextfile(g))
                    .toArray(String[][]::new);
        } catch (IOException e) {
            e.printStackTrace();
        }
        for (int i = 0; i < TextMass.length; i++) {
            if (TextMass[0].length == 1) {
                Functions.writefile(OutTextFile, getDigits(TextMass[i][0].replace("s", "x")));
            }
            if (TextMass[0].length == 2) {
                     Functions.writefile(OutTextFile, getDigits(TextMass[i][0].replace("s", "x")) + " " + TextMass[i][1]);
            } else {
                Functions.writefile(OutTextFile, TextMass[i][0] + " " + getDigits(TextMass[i][1].replace("s", "x")) + " " + TextMass[i][2]);
            }
        }
    }

    public static String getDigits(String s) {
        if (!s.matches("^.*([r|-][w|-][x|-]){3}$")) {
            throw new IllegalArgumentException("Achtung!");
        }
        Function<String, String> rwxMapper = rwx -> String.valueOf(Integer.parseInt(rwx.replaceAll("[rwx]", "1").replaceAll("-", "0"), 2));
        return Arrays.stream(s.substring(s.length() - 9).split("(?<=\\G...)")).map(rwxMapper).collect(joining());
    }

Что делает: читает файл в двумерный массив, выодит из массива в новый файл заменяя уже пересчитыными значениями

Iska, бинго Но не факт что это тот способ верный.