[_arahnid_]

xxxNestrxxx, Добрый день. В каждом конкретном случае нужно разбираться отдельно. Хорошо, если ваш "исполняемый файл" имеет параметры запуска из командной строки для тихой активации, тогда просто в следующей строке ini файла указываете ваш исполняемый файл, а в соответствующем ему разделе параметры запуска. Ну или если параметров нет, то просто запускайте ваш файл без параметров в скрипте, далее на данном шаге выполнение скрипта приостановится, а вы сможете руками произвести необходимые действия, после скрипт продолжит работу, если будет что работать )))
Еще есть вариант написать на autoit маленький скрипт, который будет сам выполнять ваши ручные действия с "исполняемым файлом" например нажать кнопку, и закрыть окно.
Вообще многие программы "я говорю о лицензионных, честно купленных" имеют ключ активации, который обычно прописывается в реестр в открытом виде (не всегда), запись в реестр скриптом предусмотрена, в этой ветке есть примеры использования. Но вот где и что и куда прописывать это опять в каждом конкретном случае по-разному. Тут великий и могучий интернет вам в помощь.

Удачи.