В хелпе идентичный пример, его можно посмотреть вбив название функции [это 4 и 5 примеры]: _IEFormElementSetValue
Для вашего вопроса, 4-й пример нужно немного изменить:
Код:
#include <IE.au3>
$oIE = _IECreate("C:\Documents and Settings\xXx\Рабочий стол\123.html")
$oForm = _IEFormGetCollection ($oIE, 0)
$oInputFile = _IEFormElementGetObjByName($oForm, "file")
_IEAction($oInputFile, "focus")
Send("C:\myfile.txt")
_IEFormSubmit ($oForm)