Я форматировал утилитой из набора...
С флешками все немного по другому. Дефрагментация - это считывание данных - форматирование - запись данных (чтобы меньше тратить циклы записи, многие дефрагментаторы блоки по нескольким местам гоняют). Для SD-шных карт нашел специализированную
SDFormatter