Для начала - оставить только один раздел на флэшке. Сам в свое время столкнулся с проблемой аналогичной, правда, там был ноутбук MSI, а не материнская плата, но не думаю, что в данном случае есть разница. Видимо, программисты MSI не в курсе, что бывают съемные накопители с двумя и более разделами.
Что же касается звука, то при таком раскладе как у вас обычно просто выбирают S/PDIF Pass-Through в настройках плеера, чтобы ни плеер, ни система, ни драйвер не вмешивались в воспроизведение звука, а просто отсылали акустике звуковой сигнал "как есть". И дальше она ужа сама пускай его декодирует и раскидывает по каналам.
Но в целом, кстати, ситуация вполне обыденная: порой вендоры что-то своё, уникальное решают запилить и работает оно, естественно, только с их драйвером. MSI давно уже пихает в свои платы всякие фичи типа сетевых карт с уменьшенной задержкой и т.п. Теперь до звука докопаться решили, видимо.
