[Bobis]

Elven,
Вот что у меня получилось.
@echo off
pushd "C:\Prepare\" && (for /f %%i in (C:\TEMP\destinations.txt) do (for /f %%j in ('dir /B /S %%i?') do @copy "C:\TEMP\121512_short.xlsx" %%~fj)) && popd

При этом результат "Файл не найден."

Хотя вроде маршруты все правильные.