Как вариант воспользоваться
"портабельным" "FAR", он, вроде как, умеет удалять такие файлы.
Так же можно поизвращаться с помощью
subst, чтобы укоротить путь к файлу.
Попробуйте выполнить
chkdsk на загрузочном томе, возможно утилита исправит сие недоразумение?