Можно отключить индексацию на этом диске, если не используете поиск Windows
а также дефрагментацию настроить по другому расписанию (при использовании диска не в качестве системного, а для хранения файлов его фрагментация обычно не растет такими быстрыми темпами, если, конечно, торрент не используете)
Также проверьте, что файл подкачки у вас на SSD.
Все это должно снизить частоту обращений
системы к диску, а с программами вы уж как-нибудь сами