В составе этой программы в папке codecs64 идёт ffmpeg.exe. Можно попробовать так:
Код:
& "C:\Program Files\MediaCoder\codecs64\ffmpeg.exe" `
-i "C:\temp\video.mp4" -i "C:\temp\english.srt" -i "C:\temp\russian.srt" `
-map 0 -map 1 -map 2 `
-c:v copy -c:a copy -c:s mov_text `
-metadata:s:s:0 language=eng -metadata:s:s:1 language=rus `
"C:\temp\result.mp4"
Это Powershell, в CMD сделайте в одну строчку (убрав & в начале), я не знаю, как там переносить строки.