Cobra_1_Stas, сначала нужно определить, запускался файл или нет. См. %windir%\panther\unattedGC\Setupact.log. Если запускался, значит, команды не отрабатывают. Я бы попробовал так.
Во-первых, необязательно использовать UseConfigurationSet. Достаточно переместить $OEM$ в sources. См.
http://www.oszone.net/8603#oem
Во-вторых, можно перенести команды в myfile.cmd, разместить его в той же папке и вызывать его из setupcomplete.cmd командой call myfile.cmd.
В-третьих, импорт в HKCU не сработает. Об этом говорится в:
http://www.oszone.net/8594
http://www.oszone.net/8595
