[Iska]

После удаления букв в необходимых разделах проверка диска запускается всё равно. Только теперь вместо буквы проверяемого диска стоит знак вопроса. »

Естественно. Не все советы одинаково полезны. Снятие назначения разделу буквы никак не влияет на возможность доступа ОС к данному разделу. Можете вернуть букву на место.

Я попробовал бы исключить потребные разделы из проверки, сконфигурировав autochk посредством chkntfs.exe /x …: Chkntfs.

Но правильный совет был дан во втором сообщении.