[mountfield]

Сразу уточню, у меня версия 2.4, хотя может это и не важно.
Что значит фал не найден? Открываешь программу, потом выбираешь файл, программа пишет, что обнаружен mpeg, надо бы индексировать, жмешь ДА, потом работаешь с файлом.
По Virtualdub, сначала вырезаешь куски, я так понял, ты это уже сделал. Теперь выбираешь во что будешь кодировать. Жмешь ВИДЕО, там можешь отметить быстрая, нормальная или полная перекомпрессия. Потом там же нажимаешь "компрессия" и выбираешь кодек, которым хочешь кодировать и настройки к нему, битрейт и т.п. С аудио можешь ничего не делать, если не хочешь. Теперь жмешь ФАЙЛ-сохранить как avi, дальше я думаю сам разберешься.