prudens, Если уверены в своём диске, то можете просто отключить автопроверку дисков.
Конечно это не самый лучший выход из ситуации, но так хоть домогать проверками перестанет.
Замените кабель данных (шлейф).
читать дальше »
При неправильном выключении компьютера при последующей загрузке ОС запускается chkdisk. Для того чтобы отключить автоматическую проверку всех дисков, необходимо изменить значение ключа реестра "BootExecute" расположенного, по адресу HKEY_LOCAL_MACHINE \ SYSTEM \ CurrentControlSet \ Control \ Session Manager на " ". Также можно менять стандартное время ожидания ответа пользователя (10 секунд) при запуске автопроверки диска. Интервал значений от 0 – 259200 секунд. Для изменения периода ожидания необходимо по адресу HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Control\Session Manager создать или изменить параметр AutoChkTimeOut типа DWORD, присвоив ему значение в секундах.