[DJ Mogarych]

Я уже давно на серверах использую бесплатную программу Cobian Backup 9 (Amanita).
Из основных полезных функций: умеет работать как служба, делать инкрементные и дифференциальные архивы, слать отчёты на почту, делать теневые копии разделов; имеется встроенный архиватор zip, поддерживающий запаковку в архивы свыше двух гигабайт, также есть 7-zip. Гибко настраивается, имеет фильтры (какие типы файлов копировать, а какие нет), имеет неплохой русский перевод.
Да, забыл. Ещё Cobian Backup можно управлять удалённо, для этого есть соответствующие настройки.

В связке с ней используется бесплатная программа Ice Mirror. Это синхронизатор, запускается стандартным планировщиком Windows для синхронизации резервных копий дополнительно на внешний жёсткий диск, подключенный по USB.