Постараюсь подсказать, что знаю:
Запускаете WPI, заходите в меню (Конфигурация>>Детали) щелкаете вверху "добавить" там пишете название вашего приложения, по желанию описываете его, присваиваете ему группу и т.д, далее идете дальше (Конфигурация>>Команды), там выбираете пункт "Добавить", появится пустая строчка в окне "Команды", далее внизу слева в меню щелкаете по иконке "папка" и ищете там свое приложение, которое хотите установить автоматически. В строке "команды" появится ваш файл (точнее путь к нему), дописываете в конце этой строки нужные вам ключи и ВСЕ! Запускаете WPI и наслаждаетесь автоматической установкой вашего софта
P.S Это я описал простой вариант установки, без внесений в реестр, TASKKILLa и т.д
