[Ment69]

Atle, Изменяя время в операционной системе вы естественно меняете его в биосе, таймер то один.

Можно ли сделать настройки времени в BIOS не зависимыми от синхронизации? »

Отключите синхронизацию.
А теперь главный вопрос - нафига вам это нужно???