Всё по видимому так как вы пишете. Runonce насколько я понимаю отрабатывает ДО загрузки профиля пользователя. и после отработки Runonce, начинает грузится профиль и в след за ним ЕГО авто запуск. Для каспера уже произошла "перезагрузка"
А вот как ему запретить, вопрос интересный. Можно в настройках зарание выключить авто запуск. Но как потом его восстановить? Идеи есть, но все они не очень красивые...
