[Anton04]

Очень много ответов на Ваши вопросы зависит от ситуации и текущих задач, а именно непонятно есть ли ещё филиалы, сколько их, как динамично развивается компания (т.е. периодичность появления новых филиалов), количество ПК в филиале, количество человек работающих за ПК?

Раньше я был сторонником всё сломать и поднять с нуля, но постепенно я начил понимать что это как минимум не продуктивно и на текущий момент я стараюсь видоизменять структуру и доделывать её под себя, т.к. это меньше тревожит пользователей и начальство.

P.S. Идеальная структура AD - это неизменяемая со временем структура, а это в стою очередь стагнация, т.к. рост (компании) подразумевает изменения.