[Misha hm]

У меня, к сожалению, в прилагаемом текстовом файле, кракозябры)
Звуковая дорожка имеет переменный битрейт?
На сколько именно звук шел впереди?
Скорее всего, изменялась частота дискретизации с 44 до 48 кГц. Проверьте в исходном и после редактора. Кстати можно сохранять аудиодорожку на wav(идет конвертация) а в исходном формате. В Virtual Dub Mod это так: Streams - Stream list - Demux