[- Kentavr -]

Petya V4sechkin, указанного там подраздела UserChoice для .lnk у меня в реестре не существует.

Продолжая исследовать "плохие" и "хорошие" ярлыки, обнаружил ещё одну странность: беру, например, "плохой" ярлык C:\ProgramData\Microsoft\Windows\Start Menu\Programs\Paint.NET.lnk и копирую его в другое место - копия становится "хорошей". А если вместо копирования перенести ярлык, то он сохраняет свою "нехорошесть".
Очевидно что дело не в содержимом ярлыка, а в атрибутах, которые на него навешивает система. Но в чём именно? Не могу понять.
Если хорошую копию ярлыка перенести обратно в Start Menu\Programs\, то она становится "плохой". Что это значит? Атрибуты, которые портят ярлыки наследуются?