Автор просто описывает то, что видит: любые манипуляции с файлами не приводят к ожидаемым изменениям, например, если ты переименовал или удалил файл, то он так и останется висеть под старым именем в списке последних открытых файлов в каких-либо программах. Конечно, технически грамотный юзер не удивится такому, но с точки зрения простого смертного это очень странно: ты что-то сделал с файлом, а ОС и ПО никак на это не отреагировали.
Более наглядным примером несовпадения действий и ожидаемого результата является работа с ярлыками: люди удаляют ярлык, считая что это приведет к удалению программы или переносят ярлык на флэшку, считая что таким образом игра или программа перенесётся на другой компьютер. Здесь, полагаю, примерно та же ситуация, когда компьютер ведет себя не так, как ожидает пользователь.