[olen6]

Про флешку, грузиться нужно, естественно, при включенном UEFI режиме ноутбука, но флешка может быть и в MBR разметке, главное, чтобы она была в FAT32.
Возможно, система ваша больна, раз не может загрузиться. Посмотрите, сам файл SYSTEM хотя бы присутствует в папке c:\Windows\System32\config\ ?
Можно попробовать взять его SYSTEM из бекапа c:\Windows\System32\config\regback\, если он там есть, и положить в c:\Windows\System32\config\.
Режим AHCI в биосе стоит, надеюсь.