[Vadikan]

Вы утверждаете, что можно безопасно удалить и EFI и MSR разделы и это никоим образом не отразится на читаемости диска »

Я этого не утверждаю. Я утверждаю, что разделы можно удалять перед чистой установкой программой установки, потому что при нажатии на Далее она сразу же создаст все необходимые разделы. Но на читаемости диска это никак не отразится, да, ибо EFI нужен для загрузки ОС, а MSR - для всяких динамических дисков.

Чтобы удалять разделы - нужно делать установку с DVD-USB или можно с .ISO, находящегося на разделе D? »

Если вы видите это окно программы установки, то вы в Windows PE в любом случае.

а вот удаление раздела Samsung REC (FAT 32, 1024 MB), я так полагаю удалит эту утилиту, а ее как раз нужно сохранить. Так ли это, или Samsung где-то в другом месте ее установил? »

По поводу утилит самсунг обращайтесь к изготовителю или на профильные форумы.

Но все-таки, при обновлении - из старой системы частично что-то переходит в новую систему? »

При обновлении переносятся драйверы, например. Полного списка "переносится - не переносится" я не видел, и вряд ли он будет.

P.S. Думаю, ваши вопросы уже никак не относятся к этой теме.