[APOSTOL]

Насчёт разницы... Это примерно, как между двустволкой и забором, с точки зрения соседского поросёнка.

А Ява-скрипты - это такая штуковина на страничке, при помощи которой на твоём компьютере посредством твоего же браузера производятся некоторые действия чужой волей без твоего не только разрешения, но даже ведома. В простом случае - подставляются тэги. В случае средней вредности - подменяется стартовая страничка.

В большинстве случаев исполнение Явы можно запретить и в браузере и в файерволле. Насчёт помех со стороны антивирусника - не знаю... А он - который ?